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Taller I3B: Documentación digital en biodiversidad

Por , 19 mayo, 2015

Brasil2015Durante los días 13 al 17 de abril de 2015 se desarrolló en Belo Horizonte (Brasil) el taller sobre Documentación digital en biodiversidad organizado conjuntamente por el Centro de Referência em Informação Ambiental (CRIA), el INCT-Herbário Virtual da Flora e dos Fungos do Brasil (INCT-HVFF), la Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) y el Nodo Español de GBIF (GBIF.ES) en el marco del Programa Iberoamericano de Ciencia y Tecnología para el desarrollo (CYTED) por medio de la red Infraestructura Iberoamericana de Biodiversidad (I3B).

Durante el taller se expusieron diversos proyectos, técnicas e iniciativas relacionadas con la documentación digital de biodiversidad con el objetivo de mejorar la utilidad de la información disponible y aumentar la capacidad regional en la digitalización y publicación en línea de literatura científica, imágenes de biodiversidad y otros objetos multimedia.

Al taller asistieron 24 participantes entre los que se encontraron estudiantes, investigadores y profesionales en el campo de la biodiversidad procedentes de países iberoamericanos miembros de la red (Argentina, Brasil, Colombia, Costa Rica, Cuba, Chile, México, Nicaragua, Uruguay, Venezuela y España). Además se contó con la experiencia adicional de profesionales de Biodiversity Heritage Library (BHL). Tras el cierre del taller, los participantes adquirieron el compromiso de aplicar y diseminar los contenidos aprendidos en el taller en sus entornos nacionales y contribuir con la labor de hacer accesible la información biológica en sus regiones de estudio.

Materiales del taller disponibles en la página web: http://www.recibio.net/taller-i3b-documentacion-digital/

Taller I3B: Documentación digital en biodiversidad

Por , 4 diciembre, 2014

Descripción

grupo_01Fechas: 13-17 abril 2015 (15 de abril de 9:00 – 17:00 Simposio abierto al público en la Universidade Federal de Minas Gerais – UFMG)
País: Brasil.
Lugar del taller: 
Clarion Hotel Lourdes, Belo Horizonte, Minas Gerais, Brasil.
OrganizadoresCentro de Referência em Informação Ambiental (CRIA), INCT-Herbário Virtual da Flora e dos Fungos do Brasil (INCT-HVFF), Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) y Nodo Español de GBIF (GBIF.ES).
Idioma: español / portugués
Número de participantes:  por confirmar.
Ponentes: Alexandre Marino (Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA), Diana Hernandez (Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad – CONABIO), Dora Canhos (Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA), Francisco Pando (Nodo de GBIF España), Katia Cezón (Nodo de GBIF España), João Renato Stehmann (UFMG), Keri Thompson (Biodiversity Heritage Library – BHL), Maria Cândida Mamede (Instituto de Botânica, Núcleo de Pesquisa da Curadoria do Herbário de São Paulo), Maria Soledad Alonso (Museo Nacional de Ciencias Naturales – CSIC), Rosely Coelho (Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA), Sidnei de Souza (Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA), Vanderlei Canhos (Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA) y William Ulate (Biodiversity Heritage Library – BHL).
Fecha límite para el envío de solicitudes: hasta el 23 de enero.
Alojamiento: Clarion Hotel Lourdes
Rua Rua Bernardo Guimarães, 2032
Belo Horizonte – MG – CEP: 30140-082
Bairro: Belo Horizonte
Fone: (31) 3055-0650, (0)
http://atlanticahotels.com.br/hotel/belo-horizonte/clarion-hotel-lourdes
Contacto: info [at] gbif es / i3b [at] gbif es


 

Presentación y propósito del taller

La literatura científica es una de las principales fuentes de la información para la biodiversidad. Este hecho se reconoce en gran medida y como consecuencia de ello, importantes iniciativas se han puesto en marcha destinadas a digitalizar y publicar el conjunto de la literatura sobre biodiversidad. El ejemplo más notable en este sentido es la Biodiversity Heritage Library, un proyecto iniciado en EE.UU. y el Reino Unido, que está haciendo millones de páginas disponibles, casi todas ellas procedentes de la literatura científica en inglés.

Mientras que la digitalización de datos y la publicación de las colecciones es cada vez más común y rutinas de digitalización se están expandiendo entre las colecciones, la disponibilidad de información sobre la biodiversidad procedente de la literatura en el contexto de América Latina, sigue estando en gran parte sin explotar.

La principal excepción en este panorama son los esfuerzos llevados a cabo en Brasil, principalmente en “Flora Brasiliensis (http://florabrasiliensis.cria.org.br/) o el proyecto Scielo (http://www.scielo.org/) a nivel latinoamericano. Estos acontecimientos y el papel del CRIA (Centro De Referência Em Informação Ambiental) en estas iniciativas hacen totalmente apropiado basarse en el CRIA para co-liderar este taller. Además, se contará con la experiencia adicional de BHL y el equipo de la «Biblioteca Digital del Real Jardín Botánico» (http://bibdigital.rjb.csic.es/ing/).

El impacto del taller es disponer de  literatura científica clave para que  los países latinoamericanos  puedan conocer y gestionar su biodiversidad de la manera más eficiente posible: evitando repetir estudios que ya se han hecho, procurando un acceso en línea a esta documentación.

El énfasis se establece en la producción científica propia: revistas y obras de referencia nacionales, literatura gris (tesis, estudios, reportes), fundamentalmente en español y portugués no disponibles en línea.

Objetivos específicos:

  • Aumentar la capacidad regional en la digitalización y publicación en línea de literatura científica en materia de biodiversidad

  • Aumentar la capacidad regional en la digitalización y publicación en línea de imágenes de biodiversidad y otros objetos multimedia

  • Fomentar el desarrollo de proyectos de colaboración poner en línea  publicaciones, imágenes y objetos multimedia vinculados con la biodiversidad y de carácter científico.

  • Mejorar la utilidad de la información sobre biodiversidad disponible dando a conocer los métodos y  medios técnicos más avanzados para enlazar distintas fuentes de información (estándares, herramientas, experiencias de éxito, etc.)

A quién va dirigido

El taller es exclusivamente para miembros de países iberoamericanos y va dirigido a científicos y profesionales con responsabilidades y conocimiento técnico en la gestión de fondos documentales y/o colecciones biológicas ; sobre todo desde el punto de vista de su digitalización (facsímiles digitales) y con capacidad para diseminar los contenidos del taller en sus contextos.

Criterios de selección y perfil esperado de los participantes

  • Contar con el apoyo de un miembro de la plataforma I3B o de un nodo latinoamericano de GBIF para llevar a cabo actividades de digitalización literatura y colecciones (imágenes) de colecciones biológicas en su país.

  • Experiencia y conocimientos en la información sobre biodiversidad o informática de la biodiversidad.

  • Estar vinculado con bibliotecas, centros de documentación y colecciones que tengan planes o proyectos específicos de digitalización y puesta en línea de sus fondos en su país o en la región.

  • Capacidad y compromiso para difundir los contenidos del taller.

Los candidatos serán seleccionados a partir de sus méritos y su adecuación a los criterios de selección sobre la base de la información proporcionada en el formulario de inscripción y la información adjunta requerida (resumen de C.V., carta de recomendación de la institución a la que pertenece y carta de apoyo de los nodos de GBIF o miembros de I3B).

Descarga aquí el formulario de inscripción.

Solicitudes y proceso de selección de candidatos

El proceso de selección se llevará a cabo en dos pasos:

1.- Los interesados tendrán hasta el 23 de enero para enviar sus candidaturas a sus respectivos miembros de la red I3B y/o coordinadores de los nodos de GBIF en Latinoamérica. Éstos han de seleccionar sus candidatos en los términos que consideren oportunos y establezcan. Los miembros I3B y nodos de GBIF tendrán del 26 al 30 de enero de 2015 para revisar las candidaturas recibidas,  y deberán remitir las nominaciones (hasta un máximo de dos) a i3b [at] gbif es antes del 30 de enero de 2015.

2.- Un comité de selección, establecido por la coordinación de la I3B, hará la selección final sobre los candidatos nominados en el paso anterior. Tanto los participantes aceptados como los excluidos serán informados el 2 de febrero de 2015.

Financiación

Idealmente los candidatos seleccionados tendrán todos los gastos de viaje, alojamiento y manutención cubiertos, no obstante, asumir parte de estos gastos por parte del participante o del nodo GBIF o miembro I3B que lo apoya, ayudará a que ese candidato sea seleccionado. El taller no conlleva gastos de inscripción.

En el caso de haber interesados procedentes de países latinoamericanos que no son miembros de GBIF ni de I3B, se considerará su candidatura siempre que:

  • el candidato esté involucrado profesionalmente en proyectos o iniciativas de temática similar a la desarrollada en el taller y cuyos objetivos estén alineados con los de GBIF;
  • los costes derivados de transporte, alojamiento y manutención sean cubiertos por el interesado;
  • haya plazas suficientes.

Calendario

  • Publicación de la convocatoria para Nodos de GBIF y miembros de I3B: 16 diciembre 2014
  • Cierre de plazo de inscripción: 23 enero 2015
  • Selección de candidatos por parte de los nodos de GBIF o miembros de I3B: 26 enero – 30 enero 2015
  • Envío de solicitudes al Comité de Selección establecido por la coordinación de la I3B: 30 enero 2015
  • Anuncio de participantes seleccionados: 2 febrero 2015
  • Realización del taller: 13-17 abril 2015

Programa

Agenda

Lunes, 13 abril 2105

8:30 – 9:00 Bienvenida y presentaciones

9:00 – 9:30 Introducción al taller

09:30 – 10:00  Documentación digital– Francisco Pando

10:00 – 10:30  Herbario Virtual Brasil (HVBr):Estratégia, evolução e impacto  – João Renato Stehmann

10:30 – 11:00 Receso / Café

11:00 – 12:00 Vídeos y grabaciones – Maria Soledad Alonso

12:00 – 12:30 Los facsímiles digitales

  • 3D Imagens digitais de anfíbios–  Felipe Leite

12:30 – 14:00 Almuerzo

14:00 – 15:30  Los facsímiles digitales (continuación)

  • Láminas botánicas (Mutis) – Francisco Pando

  • Serviço Exsiccatae (imagens de herbários) y Metadatos – Sidnei de Souza

15:30 – 16:00 Receso / Café

16:00 – 17:00 Herramientas y equipos de captura – Maria Cândida Mamede

Martes, 14 abril 2105

08:30 – 10:30 Iniciativas, características generales:

  • BHL – William Ulate y Keri Jane Thompson

  • Biblioteca Digital del Real Jardín Botánico – Francisco Pando

  • Scielo – William Ulate

  • Digitalización de las Floras de México – Diana Hernández

10:30 – 11:00 Receso / Café

11:30 – 12:30 Iniciativas, características generales (continuación):

  • Repositorio de imágenes de GBIF.es – Katia Cezón

  • Redes species Link – Alexandre Marino

12:30 – 14:00 Almuerzo

14:00 – 15:30 Captura y almacenamiento

  • BHL – William Ulate y Keri Jane Thompson

  • Proyecto Mutis – Francisco Pando

  • Flora Brasiliensis – Sidnei de Souza

15:30 – 16:00 Receso / Café

16:00 – 16:30 Ejemplos prácticos

  • Imágenes digitales en el Portal de datos de GBIF – Danny Vélez

  • Demostración / ejercicio práctico Species Link, etc. – Alexandre Marino, Sidnei de Souza

16:30 – 17:00 Discusión/debate

Miércoles, 15 abril 2015

Simpósio: Redes Colaborativas e a Documentação Digital sobre Biodiversidade na Iberoamerica

Jueves, 16 abril 2105

08:30 – 9:00 HVBr / Lacunas – Dora Canhos

09:00 – 10:00 HVBr/BioGeo – Renato de Giovanni

10:00 – 10:30 Licencias y copyrights – Francisco Pando

10:30 – 11:00 Receso /Café

11:00 – 12:30 Organización del trabajo (flujos de trabajo)

  • BHL – Ejercicio práctico – William Ulate

  • OAI PMH – William Ulate

12:30 – 14:00 Almuerzo

14:00 – 14:40 Organización del trabajo (flujos de trabajo) – continuación

  • Cienciatk del CSIC – Maria Soledad Alonso

14:40 – 15:30 Ejercicio práctico con imágenes – Francisco Pando

15:30 – 16:00 Receso / Café

16:00 – 17:00 Escenarios de cooperación (espacio de discusión)

 

Viernes, 17 abril 2015

08:30 – 9:30 Portales y acceso a la información. Funcionalidades, licencias y copyright de las 5 iniciativas

  • BHL – Keri Jane Thompsom

  • HVBr – Dora Canhos

  • Cienciatk del CSIC – Maria Soledad Alonso
  • Flujo de trabajo y publicación de imágenes en el repositario de GBIF.es – Katia Cezón

9:30 – 10:30 Exposición de los participantes (15′ cada uno)

10:30 – 11:00 Receso / Café

11:30 – 12:30 Exposición de los participantes (15′ cada uno)

12:30 – 14:00 Almuerzo

14:00 – 15:30 Exposición de los participantes (15’ cada uno)

15:30 – 16:00 Pausa para café

16:00 – 16:30 Mesa redonda: Futuro y sostenibilidad

16:30 – 17:00 Evaluación y conclusiones

Descargas

Presentaciones a cargo de los instructores y vídeos correspondientes

Presentaciones a cargo de los participantes

Recursos informáticos utilizados

  • Biblioteca Digital del Real Jardín Botánico (CSIC): servicio de información de bibliografía botánica en línea.
  • Bibmaster: aplicación de bases de datos para gestión de proyectos de biodiversidad. Facilita la gestión de bibliografías, autores, palabras clave, nomenclatura, check-lists, listas de material, etiquetas de herbario, ilustraciones e información a nivel de taxon.
  • Findit2DarwinCore: programa que rellena tablas de Darwin Core de MS Access a partir de los nombres científicos almacenados en documentos PDF ubicados en direcciones web.
  • Name Parser: Se trata de una aplicación con base de datos MS Access para desglosar nombres científicos en sus componentes básicos: género, especie, autor de la especie, rango infraespecífico, epíteto infraespecífico, autor infraespecífico y año.

Participantes

Participantes

País Nombre Institución
1 Argentina Renato Mazzanti Centro Nacional Patagónico (CENPAT) – CONICET
2 Brasil Alexandre Marino* Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA
3 Brasil Danny Vélez Sistema de Informação sobre a Biodiversidade Brasileira (SiBBr)
4 Brasil Dora Canhos* Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA
5 Brasil João Renato Stehmann* UFMG
6 Brasil Maria Cândida Mamede Instituto de Botânica, Núcleo de Pesquisa da Curadoria do Herbário de São Paulo
7 Brasil Rosely Coelho* Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA
8 Brasil Sidnei de Souza Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA
9 Brasil Vanderlei Canhos* Centro de Referência em Informação Ambiental – CRIA
10 Chile Leisy Stephanie Amaya Montano Ministerio del Medio Ambiente
11 Colombia Leonardo Buitrago Hernández Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt
12 Costa Rica María Auxiliadora Mora Instituto Nacional de Biodiversidad (INBio)
13 Cuba Mercedes Doralkis Viñas Morejón Acuario Nacional de Cuba, Ministerio de Ciencia Tecnología y Medio Ambiente
14 España Francisco Pando* GBIF España
15 España Katia Cezón* GBIF España
16 España Maria Soledad Alonso* Museo Nacional de ciencias Naturales (MNCN – CSIC)
17 Estados Unidos Keri Thompson* Biodiversity Heritage Library – BHL
18 Estados Unidos William Ulate* Biodiversity Heritage Library – BHL
19 México Ana Angélica Cervantes Maldonado Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
20 México Diana Hernández* Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
21 Nicaragua Jean Michel Maes Museo Entomologico de Leon
22 Uruguay Andrés Carvajales Astapenco Dirección Nacional de Medio Ambiente
23 Uruguay Javier González Museo Nacional de Historia Natural
24 Venezuela Luzlexis Arias Museo del Instituto de Zoología Agrícola Francisco Fernández Yépez (MIZA), Universidad Central de Venezuela
* Ponentes / organizadores

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Fotografías

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